säurelabile Verknüpfungen + Abspaltung mit TFA

fragenstellen123 · Anmeldungsdatum: 19.02.2021 Beiträge: 1373

Hallo Leute!

Es handelt sich um die folgende Aufgabenstellung. In der Lösung haben sie folgende Verknüpfung gewählt (siehe Anhang). Aber kann ich auch folgende säurelabile Verknüpfungen wählen? Schließlich werden im Skript mehrere Beispiele aufgeführt (siehe Anhang).

OC-Gast · Gast

Es geht um die Säurelabilität der Estergruppe,welche die Verbindung zwischen linker und dem Peptid-Acylrest darstellt.
Die Labilität wird durch den linker bestimmt,von denen mehrere in eurem Skript vorgestellt werden.
Die Seitenkette des C-Terminus(der Estergruppe) ist dort einfach mit R1 bezeichnet,kann somit auch die Isopropylgruppe des Valins sein.
Diese hat keinen Einfluß auf die Säurelabilität.
Daher wären auch die Val-Estergruppe an den verschiedenen Harzen mit TFA (o.a. Säuren) abspaltbar.

OC-Gast.

fragenstellen123 · Anmeldungsdatum: 19.02.2021 Beiträge: 1373

Aber woher weiß ich welche säurelabile Verknüpfung passend ist? Ich versteh nicht wie ich erkennen kann ob ein Linker Einfluss auf die Säurelabilität hat oder nicht

OC-Gast · Gast

Die sauer-Katalysierte Hydrolyse von Carbonsäureestern kann nach verschiedenen Mechanismen ablaufen.Abhängig u.a. von der Art des "Alkoholrestes".
Einfache Alkylester(prim,sek Alkohol-R) meist nach Aac-Mechanismus.
Bei Estern tertiärer Alkohole findet man dagegen den Aal1-Mechanismus
(dort wird die O-R-Bindung gespalten).
Auch Ester anderer Alkohole,wo das Carbenium-Intermediat stabilisiert wird,
verlaufen nach dem Mechanismus(Benzylester..).
Je besser das Carbeniumion stabilsiert wrd,desto säurelabiler ist die Esterbindung.
Daher beim linker schauen,welche stabilisierenden Gruppen vorhanden sind.
Der Rink-Linker bildet ein deutlich stabilieres Carebniumion bei der Esterhydrolyse als z.B. ein Ester mit dem Wang-Harz.

OC-Gast.

fragenstellen123 · Anmeldungsdatum: 19.02.2021 Beiträge: 1373

Ich verteh' das leider immer noch nicht. Warum kann ich die säurelabilen Verknüpfungen, die ich oben bei meiner Frage (siehe Anhang) gepostet habe, nicht verwenden? In der Lösung haben sie diese eine säurelabile Verknüpfung gewählt, aber warum? Da haperts immer noch.

OC-Gast · Gast

Aufgabe war,einen linker zwischen Harz und der AS Valin zu wählen,der sich bereits mit 95%iger TFA-Lösung wieder spalten läßt.
Du hast als erstes das Wang-Harz( Rock

gewählt,welches nach Skript den Bedingungen netspricht.
Deine Frage geht nun darum,ob deine anderen linker-Möglichkeiten ebenfalls bei den gegebenen Bedingungen(95%ige TFA) gespalten werden.
Du hast als erstes (Pep)-Valin an ein Merrifield-Harz gebunden.
Dort werden mWn drastischere Bedingungen erforderlich zur Abspaltung.
Als nächstes noch mal das Wang-Harz und zum Schluß das TGA-Harz.
Bei den beiden letzteren ist Spaltung mit 95% TFA möglich.
Wenn man selbst Ppeptidsynthesen betreibt,muß man sich sowohl die Schutzgruppenstrategie,wie auch den passenden linker(Harz) aussuchen.
Die im Skript als hypersäurelabil beschriebenen linker können schon bei viel milderen Bedingungen abgespalten werden.

OC-Gast.

fragenstellen123 · Anmeldungsdatum: 19.02.2021 Beiträge: 1373

Also heißt das jetzt, dass die von mir gewählten säurelabilen Verknüpfungen auch richtig sind, also kann ich die auch verwenden? Sowohl die erste Verknüpfung als auch die letzten beiden?

chemiewolf · Anmeldungsdatum: 06.07.2022 Beiträge: 476 Wohnort: Rheinhessen

fragenstellen123 · Anmeldungsdatum: 19.02.2021 Beiträge: 1373

Alles klar, vielen Dank!

imalipusram

Merrifield-Harze sind praktisch kaum mehr erhältlich. Will keiner mehr verwenden (s.o.).

chemiewolf · Anmeldungsdatum: 06.07.2022 Beiträge: 476 Wohnort: Rheinhessen