 Verfasst am: 07. Okt 2024 19:43 Titel: capping |
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Damit sind die Synthesvorschriften(Kochrezepte..) gemeint,von denen es halt für das capping allein verschiedene Varianten gibt.
Dies scheint eine Variante davon zu sein,oft werden die Lösungsmittel und Basen variiert,u.U. sogar ein Basengemisch eingesetzt. Was genau hier der Vorteil von Collidin/DMAP ist,kann ich nicht sagen,ist für das grundsätzliche Verfahren des capping auch egal. OC-Gast. |
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| Verfasst am: 07. Okt 2024 16:10 Titel: |
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| Ja schon, aber mich hat Collidin total verwirrt.
Aber was meinst du genau mit Protokolle? Also ich check immer noch nicht, warum im Skript Collidin steht... |
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| Verfasst am: 07. Okt 2024 15:52 Titel: capping |
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Also eigentlich sollte man sich bei dem Aufgaben-level eine solche Frage nicht mehr stellen. DMAP,4-N,N-Dimethylaminopyridin ist etwas anderes als Collidin(sym-Collidin wäre 2,4,6-Trimethylpyridi). Wie oben gesagt,gibt es auch Protokolle mit Collidin(das hast du ja hier im thread eingeführt,in den Zeichnungen im Skript/von dir steht nur DMAP),das sind einfach Varianten mit optimierter Reaktion. Man findet auch welche mit Lutidin. Wichtig ist,daß die N-Base ein ausreichend guter Säurefänger ist,um die beim capping gebildete Essigsäure abzufangen. OC-Gast. |
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| Verfasst am: 07. Okt 2024 15:23 Titel: |
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| Ist Collidin nicht gleich Dimethylaminopyridin? Ich check nicht warum hier Collidin steht, Collidin taucht nirgendswo auf. | |
| Verfasst am: 07. Okt 2024 09:36 Titel: capping |
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| Ja,der pH-Wert bleibt so unverändert,die N-Base muß daher auch stöchiometrisch eingesetzt werden.U.U. wird auch ein Basengemisch verwendet,die Rolle des Collidins ist mir hier nicht ganz klar,kommt auf die Mengenverhältnisse an,ist aber oft als capping-Reagenz(mit anderem) zu finden.
OC-Gast. |
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| Verfasst am: 07. Okt 2024 00:47 Titel: |
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| Alles klar, also Dimethylaminopyridin deprotoniert die Essigsäure sozusagen und hält den pH-Wert im basischen Bereich bzw. konstant, je nach dem, oder? | |
| Verfasst am: 06. Okt 2024 18:33 Titel: capping |
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Ac2O + ROH -> Ac-O-R + HOAC (Essigsäure). Bei der direkten Umsetzung wird Essigsäure frei,die beim capping verwendeten Basen wie BMAP oder NMI dienen am Ende auch als Säurefänger,die den pH-Wert ausreichend hoch halten. Ansonsten könnte die Essigsäure teilweise Entschützung bestimmter Gruppen bewirken. OC-Gast. |
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| Verfasst am: 06. Okt 2024 17:22 Titel: |
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| Vielen Dank für deine Rückmeldung OC-Gast!
Kannst du mir das mit dem pH-Wert genauer erklären, den Sinn dahinter habe ich nämlich nicht verstanden. Die Reaktionsbedingungen sind: Essigsäureanhydrid/Collidine/Dimethylaminopyridin in Acetonitril. Aber warum wird hier Dimethylaminopyridin verwendet? Hat das was mit dem pH-Wert zu tun? |
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| Verfasst am: 06. Okt 2024 16:56 Titel: capping |
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| Versteh deine Frage nicht ganz.
Im Skrip ist das capping,also die blockierung der freien OH-Gruppe durch Acetylieren beschrieben.Capping-Reagenzien hier acetanhydrid und eine Base,4-Dimethylaminopyridin. Es können auch andere N-Basen verwendet werden.Wicht ist dabei die pH-Kontrolle,daß die Tritylschutzgruppe nicht durch freie Essigsäure gespalten wird. Ansonsten einfach Ester-Bildung(O-Acetylierung von Alkohol) mit Acetanhydrid.Da grift kein Acetat an,sonder die Acetylgruppe(aus aktivierung des Ac2O mit Base).wird auf die feie OH-Gruppe übertragen,das freiwerdende H+ von der Base ufgenommen. Alternative N-Basen z.B. NMI(N-Methyl-imidazol). OC-Gast. |
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| Verfasst am: 06. Okt 2024 16:05 Titel: Phosphoramidit - Capping |
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| Hallo an alle,
es handelt sich um die Festphasensynthese und zwar um das Capping. Ich kann hier nicht ganz nachvollziehen, welches Molekül genau inaktiviert wird. Wird der 5‘OH des Phosphoramidit-Bausteins inaktiviert oder wird die 5’ HYdroxygruppe eines normalen Nukleosid inaktiviert. Das versteh ich nicht ganz. Ich habe oben das was im Sktipt stand herausgeschrieben und unten bei „Mechanismus-Capping“ stehen meine Überlegungen. Ich versteh auch nicht warum diese Linker (in organge markiert) so dargestellt sind, was bedeutet das in diesem Fall? Ist hier eine art kopplung dargestellt? |
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